Активность партийного руководства по разоблачению "врагов народа" подстегнула органы НКВД на выявление крупных "контрреволюционных организаций" ("групп", "блоков", "центров" и т. п.), которые якобы проникли во все структуры власти.

    Ликвидация проводилась, как правило, по наработанной годами схеме. В следственных делах обязательно присутствовал московский или всесоюзный "контрреволюционный" центр. В регионе "выявляли" его филиалы. Звенья в цепи "организации" выстраивались как по вертикали, так и по горизонтали. "Участники организации" могли быть связаны друг с другом общей "контрреволюционной" деятельностью на уровне района, области (края), республики и страны. Вскрытие таких "организаций" стало повсеместным явлением.

     В июне-декабре 1937 года в Ярославской области органы НКВД раскрыли и ликвидировали:

     1) "Троцкистско-террористическо-диверсионную организацию" во главе с бывшими секретарями обкома партии А. Р. Вайновым и И. А. Нефедовым.

     2) "Террористическо-повстанческую организацию правых" во главе с бывшими председателем облисполкома Г. Г. Заржицким и его заместителем А. В. Хлыбовым

    В отчетах УНКВД за 1938 год эти две "организации" объединены под общим наименованием "право-троцкистский блок" в Ярославле. По делу "блока" было осуждено 50 человек, из них к расстрелу приговорено — 34 человека.

    3) "Право-троцкистскую террористическую организацию среди молодежи" во главе с бывшими секретарями обкома комсомола Б. И. Павловым и А. В. Смирновой. По делу арестовали только в Ярославле 25 человек.

    4) "Диверсионно-террористическую организацию правых в льняной промышленности" во главе с бывшим секретарем Костромского горкома партии Г. А. Полумордвиновым и председателем горсовета П. Н. Михалевым. По делу осудили 23 человека, из них к расстрелу приговорили 21.

    5) "Организацию правых" в органах связи во главе с начальником управления связи И. С. Желтовым и главным инженером И. З. Соболем. По версии следствия, ее "создали по заданию" наркома связи СССР А. И. Рыкова. Она охватывала своей деятельностью 18 районов области. Только в Ярославле арестовали 32 человека, из них к расстрелу приговорили — 24.

    6) "Троцкистскую группу" в аппаратах облпрокуратуры и облсуда во главе с заместителем прокурора по надзору за следствием в органах НКВД Ф. Л. Марчуком. Дело на эту "группу" возникло по докладной записке прокурора области Б. К. Юрчука и его помощника П. Д. Прокопенко в обком партии. Ф. Л. Марчук и другие прокуроры обвинялись в дискредитации и клевете на органы НКВД.

    7) "Право-троцкистскую антисоветскую организацию" на Ярославской железной дороге во главе с бывшими начальниками дороги А. М. Амосовым, В. В. Винокуровым и действовавшим тогда начальником дороги М. М. Егоровым.

    Помимо этого вскрыли и другие многочисленные "вредительские организации" в городах и районах области.

    Одновременно с проведением политической "чистки" партийных, советских и хозяйственных организаций повсеместно начались массовые репрессии "антисоветских элементов". В адрес НКВД СССР, ЦК нацкомпартий, обкомов и крайкомов ВКП(б) стали периодически поступать "строго секретные" решения Политбюро ЦК ВКП(б), ориентировавшие эти структуры на проведение широкомасштабных репрессий. В документе от 2 июля 1937 года "Об антисоветских элементах", подписанном И. В. Сталиным, объявлялось, что бывшие кулаки и уголовники, вернувшиеся после высылок в свои области, "являются главными зачинщиками всякого рода антисоветских и диверсионных преступлений как в колхозах и совхозах, так и в некоторых отраслях промышленности".

    ЦК ВКП(б) предлагал партийным организациям и органам НКВД взять их всех на учет, с тем чтобы "наиболее враждебные из них были немедленно арестованы и расстреляны в порядке административного проведения их дел через "тройки", а остальные менее активные, но все же враждебные элементы были бы переписаны и высланы в районы по указанию НКВД". Партийные руководители на местах и органы НКВД должны были представить в ЦК состав "троек", а также данные о количестве лиц, подлежавших репрессированию.

    На основании этой информации в НКВД СССР подготовили приказ N 00447 "О репрессировании бывших кулаков и уголовников и других антисоветских элементов", утвержденный 31 июля 1937 года Политбюро ЦК ВКП(б). Перед органами госбезопасности ставилась задача "самым беспощадным образом разгромить всю эту банду антисоветских элементов (члены бывших политпартий, участники различных восстаний периода гражданской войны, военнослужащие белых армий, каратели, репатрианты и т. д.), защитить трудящийся советский народ от их контрре волюционных происков и, наконец, раз и навсегда покончить с их подлой подрывной работой против основ советского государства". Операцию следовало начать с 5 августа 1937 года во всех регионах СССР. 

    Репрессируемые лица согласно этому приказу распределялись на две категории. К первой относились приговариваемые "тройками" к расстрелу, ко второй — к заключению в лагеря и тюрьмы на срок от 8 до 10 лет. Просчитали и так называемые "лимиты", т. е. ограничения на количество лиц, подлежавших репрессированию в регионах. В Ярославской области следовало репрессировать 2000 человек (по 1 категории — 750, по 2 категории — 1250). Всего по СССР предполагалось репрессировать 259 450 человек.

    Указанные в приказе "лимиты" были не окончательными и в процессе проведения репрессий "нарушались" в сторону увеличения. На каждого репрессируемого собирали компрометирующие материалы, на основании которых органы НКВД составляли "списки" на арест. Следствие проводили ускоренно и в упрощенном порядке, при этом следователи выявляли все "преступные" связи арестованных.

    В июле-сентябре 1937 года НКВД СССР принял еще ряд специальных приказов по репрессированию лиц различных национальностей: N 00439 (немецкой), N 00485 (польской), N 00593 ("харбинцев" бывших служащих Китайско-Восточной железной дороги и реэмигрантов из Маньчжоу-Го), N 00486 (жен "изменников Родины, членов право-троцкистских, шпионско-диверсионных организаций") и др.

    Порядок проведения ликвидационных операций и ведение следствия по этим делам были такими же, как и по приказу N 00447. Разница заключалась лишь в том, что по окончании расследования дела поступали не на "тройку", а в Военную коллегию Верховного суда СССР или на Особое совещание при НКВД СССР (приказы 00439 и 00485) и на "двойку" — НКВД и прокурора СССР (приказ 00593). В 1938 году НКВД СССР принял еще ряд приказов, дополнявших предыдущие и продлявших проведение спецопераций на новые сроки.

    В порядке исполнения приказа N 00447 с августа 1937 по июль 1938 года органы УГБ и УРКМ Ярославского управления НКВД арестовали 2510 человек, ДТО ГУГБ НКВД Ярославской железной дороги — 475 человек. Как отмечалось в отчетах УНКВД, "оперативный удар" по линии органов госбезопасности был нанесен в основном по так называемой "организованной контрреволюции". По другим спецприказам за этот же период УНКВД Ярославской области репрессировало 910 человек, ДТО ГУГБ НКВД Ярославской железной дороги — 276 человек.

    О проведении спецопераций в Ярославской области в 1937—1938 годах сохранились свидетельства очевидцев тех лет. Массовым арестам предшествовало указание начальника УНКВД А. М. Ершова. Он заявил, что из центра получен приказ "очистить" область от всего "антисоветского элемента" путем массовых арестов. Ершов разъяснил, что оперативному составу вне зависимости от наличия оперативных материалов необходимо подвергнуть аресту всех бывших офицеров белой и царской армий, участников Ярославского белогвардейского мятежа, антисоветски настроенных поляков, а также латышей, эстонцев, финнов, китайцев и корейцев.

    Ершов дал указание арестовывать в первую очередь тех лиц, на которых в УНКВД имелись оперативные материалы, остальных — по ходу следствия, и получать от арестованных "признательные" показания. При этом он еще раз подчеркнул, что задача Управления НКВД — "очистить" область от этих контингентов. Вопрос о получении санкции на их арест был решен и согласован с прокурором области.

    В июле-сентябре 1937 года в Ярославле арестовали группу из 92 человек, представлявшую собой, как указано в материалах следствия, "повстанческо-террористическую организацию польской разведки". Эту "организацию" якобы возглавлял В. Д. Головщиков — бывший офицер белой армии, проживавший до 1926 года в Польше и состоявший одновременно в разведке у Б. В. Савинкова и в польском генштабе. Выполнив отдельные поручения советского полпредства в Польше, он выехал на жительство в СССР.  14 января 1938 года всех проходивших по этому делу лиц на основании приказа N 00485 решением комиссии НКВД и прокурора СССР приговорили к расстрелу. Помимо этого органы Ярославского УНКВД ликвидировали аналогичные "организации" — "эсеров" (99 человек), "меньшевиков" (26 человек) и другие.

    14 января 1938 года начальник Ярославского УНКВД сообщил Н. И. Ежову об итогах операций по спецприказам. В процессе следствия "было установлено, что право-троцкистские организации, ликвидированные в Ярославской области, в своей практической антисоветской деятельности сомкнулись с немецкой, польской и японской разведками, с повстанческо-террористическо-диверсионными формированиями в промышленности и на селе, создав единый контрреволюционный фронт", 72 процента "контрреволюционеров" которого к отчетному сроку по области были арестованы, а следовательно, указания НКВД о разгроме "организованной контрреволюции" в основном выполнены